דיקור מי שפיר מבוצע בשליש השני של ההיריון, לרוב בין השבועות 17-20 אך לא יאוחר מ 22+6 שבועות.

בדיקת דיקור מי שפיר:
דוגמים ממי השפיר לצורך אבחון מומים כרומוזומליים (ביניהם תסמונת דאון) ומחלות תורשתיות.

דיקור מי השפיר מתבצעת תמיד במסגרת בית חולים (ד"ר רון ברדין מבצע את דיקור מי שפיר בבית החולים אסותא שבתל אביב).

דיקור מי השפיר מבוצע לאחר מספר הכנות שעיקרן:
- רחצה סטרילית של הבטן
- כיסוי הבטן במפיות סטריליות (עיקר הזמן בבדיקה כרוך בהכנות אלו)

דיקור מי השפיר מבוצע תחת הדמיית אולטרה סאונד רציפה במהלכה נשאבים לרוב כ 20-30 סמ"ק מי שפיר- תהליך זה קצר בדרך כלל .
נוזל מי השפיר הוא לרוב צלול בגוון צהבהב- זהו למעשה השתן של העובר. נפח מי השפיר חוזר מהר מאוד לכמות הרגילה.